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Analisi dei dati

Numerose fototrappole sul campo necessarie per un determinato studio producono una grande mole di dati, non solo sottoforma di foto e/o video. Quando si conduce un progetto di studio tramite fototrappolaggio è infatti importantissimo segnare molte tipologie di dati su delle tabelle (per esempio su Excell) o meglio ancora su un database relazionale (per es Access o SQL) e organizzare minuziosamente i files fotografici e/o video prodotti dalle fototrappole. Nel database le tabelle sono collegate tra loro rendendo più facile l’analisi dei dati. Una prima tabella dovrà contendere i dati utili per calcolare lo sforzo di campionamento, dunque per ogni punto di campionamento verrà segnata la data di inizio dell’attività di fototrappolaggio e la data di fine oltre che la fototrappola utilizzata

Punto di campionamento	Inizio attività di fototrappolaggio	Fine attività di fototrapplaggio	Fototrappola utilizzata
Punto A1	01-01-2018	31-03-2018	Camera 1
Punto A2	31-01-2018	30-06-2018	Camera 2

 

In una seconda tabella si registreranno le informazioni relative ai diversi punti di campionamento insieme ad eventuali altri parametri, ad esempio quelli ambientali

Punto di campionamento	Latitudine GPS	Longitudine GPS	Altitudine	Copertura arborea
Punto A1	15.23543	-50.42132	348 m	45%
Punto A2	15.23452	-60.57943	200 m	79%

 

Un’altra tabella conterrà i dati estratti dalle foto o video derivanti dalle fototrappole, ad esempio la specie osservata, il sesso, l’età e il nome del file della foto o video relativa, oltre che data, ora e punto di campionamento.

 

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Softwares per l'analisi dei dati delle fototrappole

I progetti basati sul fototrappolaggio producono una grande mole di dati sotto forma principalmente di foto ma anche di video. Esistono per fortuna una serie di softwares, alcuni anche gratuiti che consentono di gestire più facilmente questi grandi archivi e anche di analizzare i dati.

I softwares per la gestione dei dati provenienti dalle fototrappole non sono da confondere con i softwares che invece verranno utilizzati per poi analizzare i dati estratti dalle foto/video; per questi scopi si useranno softwares generici come R o MATLAB o più specifici come MARK o Presence.

Esistono numerosi softwares specifici per il fototrappolaggio ma questi differiscono moltissimo per le funzioni disponibili e l’approccio con cui consentono di organizzare i dati; è dunque difficile consigliare un software specifico e si consiglia, prima di iniziare un progetto, di testarli e provarli tutti al fine di capire meglio quale software risulti più adatto per i propri scopi. In linea generale questi softwares lavorano meglio con le immagini, mentre hanno più difficoltà ad estrarre informazioni dai video e anche per questo in molti progetti di studio basati sul fototrappolaggio si consiglia di impostare le fototrappole in modalità fotografica invece che video; il video è consigliato fondamentalmente solo per gli studi comportamentali. Ad esempio, quasi tutti i modelli di fototrappole registrano sugli EXIF dei files jpg delle foto tutta una serie di informazioni tra cui il nome assegnato alla fototrappola, le coordinate GPS, la data e l’ora esatta dello scatto e le impostazioni di scatto; i softwares riescono a leggere facilmente queste informazioni in modo automatico; nei files video invece attualmente non è possibile inserire o estrarre queste informazioni, ad esempio la data e l’ora vengono scritte direttamente sui fotogrammi del video e questa informazione non può essere quindi estratta automaticamente dai softwares per cui per ogni video bisogna segnare manualmente la data e l’ora nel database; è assolutamente sconsigliabile basarsi sulla data e l’ora scritta sui dettagli del file (data di creazione, data di ultima modifica) perché questa informazione è imprecisa, non sempre corrisponde alla data e ora reali in cui il video è stato realizzato e può cambiare nel tempo in base al sistema operativo che si utilizza, ad esempio copiando una cartella video da un’unità di memoria ad un’altra.

 

Camera Base: http://www.atrium-biodiversity.org/tools/camerabase/

Extract Compare: http://conservationresearch.org.uk/Home/ExtractCompare/

Automatic Storage and Analysis of Camera Trap data: http://esapubs.org/archive/bulletin/B091/002/suppl-1.htm

Timelapse: http://saul.cpsc.ucalgary.ca/timelapse/pmwiki.php?n=Main.HomePage

Wild-ID: https://home.dartmouth.edu/faculty-directory/douglas-thomas-bolger

WWF Malaysia Camera Trap Software: https://rimbaresearch.org/2012/01/05/toolbox_update_5/#more-1160

Aardwolf: https://sourceforge.net/projects/aardwolf/

Camera Trap Manager: https://github.com/benizar/cameratrapmanager

CPW Photo Warehouse: https://cpw.state.co.us/learn/Pages/ResearchMammalsSoftware.aspx

Agouti: https://www.agouti.eu/

eMammal: https://emammal.si.edu/

CamtrapR: https://cran.r-project.org/web/packages/camtrapR/

Trapper: https://bitbucket.org/trapper-project/trapper-project

SpeedyMouse: https://www.researchgate.net/publication/289202434_SpeedyMouse_22_for_the_analysis_of_camera_trap_images

Camelot: https://gitlab.com/camelot-project/camelot

ViXeN: https://github.com/vixen-project/vixen

 

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